Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRAMEF5Q5TYX0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF5Q5TYX0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms