Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
RSPH4AQ5TD94 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
RSPH4AQ5TD94 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
RSPH4AQ5TD94 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms