Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HP1BP3Q5SSJ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HP1BP3Q5SSJ5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HP1BP3Q5SSJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms