Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRMS1LQ5PSV4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BRMS1LQ5PSV4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms