Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM47AQ5JRC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms