Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMPK2Q5EBM0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMPK2Q5EBM0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms