Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COBLL1Q53SF7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
COBLL1Q53SF7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms