Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHLDA2Q53GA4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHLDA2Q53GA4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms