Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC38Q502W7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC38Q502W7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms