Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GREB1Q4ZG55 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GREB1Q4ZG55 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GREB1Q4ZG55 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms