Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TWISTNBQ3B726 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TWISTNBQ3B726 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TWISTNBQ3B726 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms