Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSR1Q2NL82 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TSR1Q2NL82 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TSR1Q2NL82 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms