Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC27Q2M243 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC27Q2M243 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC27Q2M243 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms