Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MICAQ29983 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAQ29983 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAQ29983 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAQ29983 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAQ29983 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAQ29983 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MICAQ29983 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MICAQ29983 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MICAQ29983 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MICAQ29983 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MICAQ29983 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MICAQ29983 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MICAQ29983 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms