Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Q1T7F1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Q1T7F1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Q1T7F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q1T7F1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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