Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CSPP1Q1MSJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSPP1Q1MSJ5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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