Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

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Length 754 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LONRF2Q1L5Z9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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LONRF2Q1L5Z9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LONRF2Q1L5Z9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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