Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RTL8BQ17RB0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RTL8BQ17RB0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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