Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRF1Q16656 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NRF1Q16656 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms