Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2Q16621 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NFE2Q16621 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms