Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPTX1Q15818 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NPTX1Q15818 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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