Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM1Q15629 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAM1Q15629 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms