Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYCP1Q15431 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYCP1Q15431 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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