Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SF3B3Q15393 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SF3B3Q15393 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SF3B3Q15393 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
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