Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCOLCEQ15113 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PCOLCEQ15113 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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