Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SHPRHQ149N8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SHPRHQ149N8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SHPRHQ149N8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
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