Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNB1Q14721 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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KCNB1Q14721 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNB1Q14721 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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