Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NEDD9Q14511 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD9Q14511 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms