Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

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Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE4AQ14139 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
UBE4AQ14139 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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