Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CDK13Q14004 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CDK13Q14004 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
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