Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCINQ13939 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCINQ13939 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCINQ13939 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCINQ13939 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCINQ13939 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCINQ13939 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCINQ13939 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCINQ13939 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCINQ13939 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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