Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC2Q13868 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXOSC2Q13868 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXOSC2Q13868 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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