Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOFQ13790 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOFQ13790 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOFQ13790 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOFQ13790 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
APOFQ13790 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOFQ13790 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
APOFQ13790 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APOFQ13790 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APOFQ13790 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APOFQ13790 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOFQ13790 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOFQ13790 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
APOFQ13790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
APOFQ13790 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APOFQ13790 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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