Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAPSNQ13702 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAPSNQ13702 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.1 ms