Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CUL3Q13618 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CUL3Q13618 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
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