Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.223e-6■■■□□ 16.7
TRA2AQ13595 ATAD5-203ENST00000585133 2686 ntTSL 22.39□□□□□ -2.034e-6■■■□□ 16.7
TRA2AQ13595 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 413.77□□□□□ -0.212e-6■■■□□ 16.7
TRA2AQ13595 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 57.97□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 16.7
TRA2AQ13595 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 54.69□□□□□ -1.662e-6■■■□□ 16.7
TRA2AQ13595 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 54.57□□□□□ -1.682e-6■■■□□ 16.7
TRA2AQ13595 TAF7-202ENST00000624699 517 ntTSL 36.93□□□□□ -1.35e-7■■■□□ 16.7
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TRA2AQ13595 SMC4-223ENST00000493695 457 ntTSL 23.14□□□□□ -1.911e-7■■■□□ 16.7
TRA2AQ13595 CANX-210ENST00000505090 485 ntTSL 29.78□□□□□ -0.841e-19■■■□□ 16.7
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TRA2AQ13595 PAFAH1B1-211ENST00000576586 557 ntTSL 416.24■□□□□ 0.192e-9■■■□□ 16.6
TRA2AQ13595 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-9■■■□□ 16.6
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TRA2AQ13595 NAP1L4-217ENST00000529361 555 ntTSL 55.63□□□□□ -1.512e-9■■■□□ 16.6
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TRA2AQ13595 PAFAH1B1-209ENST00000574816 662 ntTSL 55.36□□□□□ -1.552e-9■■■□□ 16.6
TRA2AQ13595 NAP1L4-204ENST00000448187 888 ntTSL 53.84□□□□□ -1.792e-9■■■□□ 16.6
TRA2AQ13595 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 43.8□□□□□ -1.82e-9■■■□□ 16.6
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TRA2AQ13595 WDR43-204ENST00000440983 541 ntTSL 43.55□□□□□ -1.846e-71■■■□□ 16.6
TRA2AQ13595 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.316e-71■■■□□ 16.6
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TRA2AQ13595 NUDC-203ENST00000452707 816 ntTSL 322.11■■□□□ 1.134e-9■■■□□ 16.6
TRA2AQ13595 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.294e-9■■■□□ 16.6
TRA2AQ13595 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.67e-7■■■□□ 16.5
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TRA2AQ13595 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)3.22□□□□□ -1.899e-51■■■□□ 16.4
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TRA2AQ13595 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.266e-7■■■□□ 16.4
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TRA2AQ13595 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.395e-6■■■□□ 16.4
TRA2AQ13595 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.655e-6■■■□□ 16.4
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TRA2AQ13595 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 55.3□□□□□ -1.563e-6■■■□□ 16.4
TRA2AQ13595 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.613e-6■■■□□ 16.4
TRA2AQ13595 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.733e-6■■■□□ 16.4
TRA2AQ13595 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.823e-6■■■□□ 16.4
TRA2AQ13595 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.93e-6■■■□□ 16.4
TRA2AQ13595 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.073e-6■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.173e-6■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-9■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 FAM133B-208ENST00000481407 2293 ntTSL 212.54□□□□□ -0.43e-9■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 FAM133B-203ENST00000438306 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.573e-9■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 BTAF1-201ENST00000265990 7250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.85e-8■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 FAM133B-202ENST00000427372 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.883e-9■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 FAM133B-201ENST00000415397 1890 ntTSL 57.32□□□□□ -1.243e-9■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.56□□□□□ -1.363e-9■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.795e-8■■■□□ 16.3
TRA2AQ13595 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 515.08■□□□□ 0.012e-16■■■□□ 16.3
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