Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1orf61Q13536 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf61Q13536 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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