Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTA1Q13330 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTA1Q13330 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTA1Q13330 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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