Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SRSF6Q13247 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SRSF6Q13247 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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