Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMD2Q13200 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMD2Q13200 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms