Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFT88Q13099 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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