Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPS1Q13098 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPS1Q13098 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPS1Q13098 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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