Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRDNQ13061 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRDNQ13061 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
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