Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXD4Q12950 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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FOXD4Q12950 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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FOXD4Q12950 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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FOXD4Q12950 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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FOXD4Q12950 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FOXD4Q12950 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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