Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNMA1Q12791 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNMA1Q12791 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms