Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPQ12770 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCAPQ12770 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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