Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 snR17asnR17a 333 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 BSD2YBR290W 966 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 STP22YCL008C 1158 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 LOS1YKL205W 3303 nt3.4□□□□□ -1.87
USB1Q12208 PUF2YPR042C 3228 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 GEP4YHR100C 558 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YML053CYML053C 639 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 NRK1YNL129W 723 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 IDH2YOR136W 1110 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 ALG11YNL048W 1647 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 GLO3YER122C 1482 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 ERB1YMR049C 2424 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 NCR1YPL006W 3513 nt3.39□□□□□ -1.87
USB1Q12208 SRP72YPL210C 1923 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 PRP9YDL030W 1593 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 VID28YIL017C 2766 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 HSP30YCR021C 999 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 AHA1YDR214W 1053 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 SPO74YGL170C 1242 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 ALG5YPL227C 1005 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 KIN4YOR233W 2403 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 PUB1YNL016W 1362 nt3.38□□□□□ -1.87
USB1Q12208 CDC14YFR028C 1656 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 PHM6YDR281C 315 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 PCL6YER059W 1263 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YER076CYER076C 909 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 REC104YHR157W 549 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 RSM25YIL093C 795 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 IES3YLR052W 753 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YBL036CYBL036C 774 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 NOC2YOR206W 2133 nt3.37□□□□□ -1.87
USB1Q12208 PDX1YGR193C 1233 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 UPS2YLR168C 693 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YML116W-AYML116W-A 303 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 RPL18AYOL120C 561 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 ISA2YPR067W 558 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 REB1YBR049C 2433 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 NAT1YDL040C 2565 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 MNL1YHR204W 2391 nt3.36□□□□□ -1.87
USB1Q12208 IRC22YEL001C 678 nt3.35□□□□□ -1.87
USB1Q12208 YER034WYER034W 558 nt3.35□□□□□ -1.87
USB1Q12208 CDC12YHR107C 1224 nt3.35□□□□□ -1.87
USB1Q12208 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.35□□□□□ -1.87
USB1Q12208 FLO10YKR102W 3510 nt3.35□□□□□ -1.87
USB1Q12208 SIR1YKR101W 1965 nt3.34□□□□□ -1.87
USB1Q12208 NUP85YJR042W 2235 nt3.34□□□□□ -1.87
USB1Q12208 HIS5YIL116W 1158 nt3.34□□□□□ -1.87
USB1Q12208 PSR1YLL010C 1284 nt3.34□□□□□ -1.87
USB1Q12208 UTP23YOR004W 765 nt3.34□□□□□ -1.87
USB1Q12208 RET3YPL010W 570 nt3.34□□□□□ -1.87
USB1Q12208 SPO1YNL012W 1896 nt3.34□□□□□ -1.87
USB1Q12208 FKH1YIL131C 1455 nt3.34□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YDR133CYDR133C 336 nt3.33□□□□□ -1.88
USB1Q12208 DSD1YGL196W 1287 nt3.33□□□□□ -1.88
USB1Q12208 IRC9YJL142C 393 nt3.33□□□□□ -1.88
USB1Q12208 ASC1YMR116C 960 nt3.33□□□□□ -1.88
USB1Q12208 CMR3YPR013C 954 nt3.33□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YCF1YDR135C 4548 nt3.33□□□□□ -1.88
USB1Q12208 GAL11YOL051W 3246 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 PIM1YBL022C 3402 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 MAG1YER142C 891 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 SNO1YMR095C 675 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 PRX1YBL064C 786 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 SCD6YPR129W 1050 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 NTA1YJR062C 1374 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 NAM9YNL137C 1461 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 DBP3YGL078C 1572 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 MNR2YKL064W 2910 nt3.32□□□□□ -1.88
USB1Q12208 FUN12YAL035W 3009 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 SPS2YDR522C 1509 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 CHD1YER164W 4407 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 GWT1YJL091C 1473 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 CPR1YDR155C 489 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YGL108CYGL108C 423 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YGL262WYGL262W 528 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 TOM20YGR082W 552 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YJR096WYJR096W 849 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 FOL3YMR113W 1284 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 MRPS9YBR146W 837 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 SEC6YIL068C 2418 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 RTS1YOR014W 2274 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 VMA1YDL185W 3216 nt3.31□□□□□ -1.88
USB1Q12208 APP1YNL094W 1764 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 ISW2YOR304W 3363 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 BNA1YJR025C 534 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YIL092WYIL092W 1902 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 RNR1YER070W 2667 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 SWI1YPL016W 3945 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 TCM62YBR044C 1719 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 SYT1YPR095C 3681 nt3.3□□□□□ -1.88
USB1Q12208 PRM2YIL037C 1971 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 BIK1YCL029C 1323 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 ZDS2YML109W 2829 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YHI9YHR029C 885 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 RPB3YIL021W 957 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 YIL152WYIL152W 708 nt3.29□□□□□ -1.88
USB1Q12208 FMP25YLR077W 1752 nt3.29□□□□□ -1.88
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