Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 ROK1YGL171W 1695 nt3.71□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 GZF3YJL110C 1656 nt3.71□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 NPL4YBR170C 1743 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 FAT1YBR041W 2010 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PTC1YDL006W 846 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 TAF10YDR167W 621 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PFA5YDR459C 1125 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YFL065CYFL065C 309 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YIL152WYIL152W 708 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 BNA1YJR025C 534 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 FMP46YKR049C 402 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PCL1YNL289W 840 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 HSP26YBR072W 645 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 NAM9YNL137C 1461 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 EMC1YCL045C 2283 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 DAN4YJR151C 3486 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 MET17YLR303W 1335 nt3.7□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YPR022CYPR022C 3402 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YOL019WYOL019W 1656 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 COS7YDL248W 1152 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 DIN7YDR263C 1293 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 COS5YJR161C 1152 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 APL4YPR029C 2499 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PRM1YNL279W 1986 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 ASI1YMR119W 1875 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 SPO1YNL012W 1896 nt3.69□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PHM7YOL084W 2976 nt3.68□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 CAF16YFL028C 870 nt3.68□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 ERV14YGL054C 417 nt3.68□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PRP22YER013W 3438 nt3.68□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 SPA2YLL021W 4401 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YHB1YGR234W 1200 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 SNL1YIL016W 480 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 MRS3YJL133W 945 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PSR1YLL010C 1284 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 MED7YOL135C 669 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 SCD6YPR129W 1050 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 CIT1YNR001C 1440 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 AZR1YGR224W 1842 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YJR030CYJR030C 2238 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 GEM1YAL048C 1989 nt3.67□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 AIM21YIR003W 2040 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 FLO10YKR102W 3510 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 RPC53YDL150W 1269 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 NOP6YDL213C 678 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 MYO3YKL129C 3819 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 JLP1YLL057C 1239 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 ARG80YMR042W 534 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 YNR061CYNR061C 660 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 VPS68YOL129W 555 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 snR17asnR17a 333 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 URC2YDR520C 2319 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 APP1YNL094W 1764 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 ADY3YDL239C 2373 nt3.66□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 HEF3YNL014W 3135 nt3.65□□□□□ -1.82
MSH5Q12175 PHM6YDR281C 315 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YGL199CYGL199C 471 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 MRP13YGR084C 1020 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 PDX1YGR193C 1233 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YJR037WYJR037W 384 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 AST1YBL069W 1290 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 POC4YPL144W 447 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YPR150WYPR150W 522 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt3.65□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 RPO21YDL140C 5202 nt3.64□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 DAN1YJR150C 897 nt3.64□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YBL036CYBL036C 774 nt3.64□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 IDH2YOR136W 1110 nt3.64□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 ERB1YMR049C 2424 nt3.64□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 BMS1YPL217C 3552 nt3.64□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 RTT109YLL002W 1311 nt3.64□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 FCF1YDR339C 570 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 COS12YGL263W 1143 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 PNP1YLR209C 936 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YAR070CYAR070C 300 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YML053CYML053C 639 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 FOL3YMR113W 1284 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 NCE103YNL036W 666 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 RRP40YOL142W 723 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 SPS2YDR522C 1509 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 REB1YBR049C 2433 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 SPT16YGL207W 3108 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 TAF1YGR274C 3201 nt3.63□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 SMP3YOR149C 1551 nt3.62□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 PUB1YNL016W 1362 nt3.62□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 RKM4YDR257C 1485 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 TSR1YDL060W 2367 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 YCL075WYCL075W 441 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 RSM25YIL093C 795 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 MRT4YKL009W 711 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 PEX12YMR026C 1200 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 SHH3YMR118C 591 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 TRS120YDR407C 3870 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 SMC3YJL074C 3693 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 CTR86YCR054C 1692 nt3.61□□□□□ -1.83
MSH5Q12175 POL1YNL102W 4407 nt3.6□□□□□ -1.83
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