Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC173Q0VFZ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC173Q0VFZ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms