Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF543Q08ER8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF543Q08ER8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms